علی بابایی هم در تاریخ ۲۲ شهریور ماه ۱۴۰۲، با نیابت قضایی، توسط نیروهای امنیتی در شهرستان میاندوآب از توابع استان آذربایجان غربی، بازداشت و پس از انتقال به بازداشتگاه یکی از نهادهای امنیتی در آن شهر و طی مراحل بازجویی ها و تفهیم اتهام، در نهایت به بازداشتگاه اداره اطلاعات در زندان مرکزی تبریز، منتقل و در وضعبت بلاتکلیفی بسر برده بود. ماموران امنیتی برای بازداشت علی بابایی، به محل کار وی مراجعه و او را توام با خشونت بازداشت کرده و سپس وی را برای به منزلش منتقل و پس از تفتیش و توقیف برخی لوازم شخصی از قبیل کیس کامپیوتر و چند جلد کتاب، وی را برای بازجویی به بازداشتگاه یکی از نهادهای امنیتی منتقل کردند.
شنبه ۲ دی ماه ۱۴۰۲، علی بابایی، این فعال ملی مدنی، محبوس و بلاتکلیف در زندان مرکزی تبریز مرکز استان آذربایجان شرقی، پس از طی مراحل بازجویی ها و تفهیم اتهام، با تودیع وثیقه میلیون تومانی آزاد شدند.
روز شنبه ۶ اردیبهشت ماه ۱۴۰۴، علی بابایی، ساکن شهر تبریز، پس از احضار به شعبه ۲ دادگاه انقلاب آن شهر، دستگیر شد.
به نقل از یک فرد مطلع در گفتگو با گزارشگر حقوق بشر در ایران:”در پی مراجعه آقای بابایی به شعبه ۲ دادسرای عمومی و انقلاب شهر تبریز و طی مراحل تفهیم اتهام، دستگیر شده است.” جلسات بازپرسی وی پیشتر در دی ماه و بهمن ماه ۱۴۰۳، در شعبه ۱۵ دادسرای عمومی و انقلاب تبریز برگزار شده بود. سپس جلسات دادگاه رسیدگی به اتهامات این فعال ترک (آذربایجانی) در خردادماه ۱۴۰۴ برگزار شد. وی به دو سال و ۹ ماه حبس بابت اتهام عضویت در گروه غیرقانونی و سه سال و هفت ماه حبس بابت اتهام اجتماع و تبانی علیه امنیت کشور، محکوم شد و حکم اخیراً توسط شعبه دوم دادگاه انقلاب تبریز صادر و مورخ ۸ دی ۱۴۰۴، از طریق وکیل به این شهروند ابلاغ شده است.
آقای بابایی در تاریخ ۲۴ دی ماه ۱۴۰۴، در محل کار خود در تبریز توسط ماموران اداره اطلاعات بازداشت شد. وی دو روز بعد، در تنها تماس خود با خانواده اش، اطلاع داد که در بازداشتگاه این نهاد امنیتی نگهداری می شود.
